《云南大学学报（自然科学版）》创刊于1938年，是云南省教育厅主管、云南大学主办的自然科学综合性学术刊物。主要栏目包括数学、计算机科学、电子与信息科学、物理学、地球科学、材料科学、化学、生物学（生态学）等 。现为双月刊，国内外公开发行，国际标准刊号ISSN 0258-7971，国内统一刊号CN 53-1045/N，现任主编为马文会 。
该刊1938年创刊号刊载了陈省身、赵忠尧等学者的论文。1979年恢复现刊名后经历多次改版，1986年获准国内外公开发行 。2014年被列入国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊 。2021年获评西部十二省市“十佳精品中文期刊”奖 。2020年影响因子达到1.170，入选《中文核心期刊要目总览》《中国科学引文数据库》和《中国科技论文统计源期刊》，并被美国《化学文摘》、德国《数学文摘》等国际数据库收录 。2020年、2023年、2024年开展优秀学术论文评选活动 。
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