谢邀。以修订版（三联版）为基础回答。
两部书的“磕头”，性质是不同的。
先来看天龙八部：
这里是“神仙姊姊”刻意安排的，若非跪倒磕头，就看不到鞋子上的小字。如果心意不诚，不去磕那一千个头，也就无法磕破蒲团，看到里面的秘笈。
所以，天龙里的磕头，是获得秘笈的唯一途径。
回到《倚天屠龙记》：
若非小昭这个“间谍”告知，谁也不知道这羊皮上的秘密（阳顶天的遗书里只说乾坤大挪移心法暂由谢逊接掌，并没有具体说明心法在哪里），张无忌开始并没有想觊觎明教的无上心法，只因出路被成昆（圆真）堵死，阳顶天遗书上又言明“无妄”位石门是唯一脱困之路：
张无忌想用九阳神功推动“无妄”位石门无果，只能在小昭的怂恿下，修习乾坤大挪移。不曾想因为张无忌九阳神功大成，修习乾坤大挪移势如破竹，几个时辰就练成了顶层第七层。练成后：
张无忌已经练成了乾坤大挪移，磕头是表达对明教心法的谢意，并不是获得心法的先决条件。张无忌表示会以此神功为贵教尽力，也是为后来出任教主埋下了伏笔。
所以，天龙中磕头是获得秘笈的手段，倚天中磕头是表达练成心法的感谢，两者还是不同的。
