Plantcare_启动子预测结果：
看好了！
启动子是RNA 聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA 序列，它含有RNA 聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列，多数位于结构基因转录起始点的上游,启动子本身不被转录。但有一些启动子(如tRNA启动子)位于转录起始点的下游,这些DNA序列可以被转录。启动子的特性最初是通过能增加或降低基因转录速率的突变而鉴定的。启动子一般位于转录起始位点的上游几百至几千Bp不等。
将获得的某基因转录起始位点2000Bp序列提交至Plantcare（关于如何预测可查阅其他文章，或点击直奔网站主页），即可通过邮件回执预测结果（回执结果是一个由TAB分割的表格文件，在下文使用的使用需要以tab分割导入excel），若基因数量较少时可以通过手工或肉眼即可对预测结果进行观察，并寻找是否存在目标基序，但当涉及到较多的基因数量，如整个基因家族、群体检测SNP等，则会比较费时费力；本文采用VBA编程，对Plantcare的预测结果表格文件（图1）进行筛选、分列、计数等，使其结果形成一个基因为多行（样本），基序为多列（特征）的矩阵，极大的方便了后续筛选目标基序的数量，形成了矩阵，也极大的方便了进行可视化，如热力图等。
以上就是利用上传Plantcare回执的表格，进行结果统计和数据整理，后续就可以利用该表格的特定基序数量和某一个基因的数据进行可视化，但是本表格并没有涉及到基序在启动子序列上位置的展现，这个可以通过回执附带的网页文件查看；
