机制风险是存款保险制度内生的导致银行风险意识淡化的过程与可能性，该概念由存款保险制度改革倡导者或批评者提出。在存款保险制度框架下，银行的股东可通过高风险资产获取高回报，而银行倒闭时，50万元限额以内的存款本息由存款保险基金全额偿付，超出限额的部分才由存款人依法从投保机构清算财产中受偿，风险因此主要转嫁至存款保险基金 。
央行提出强化存款保险专业化金融风险处置职能，需防范道德风险 ，并推动建立市场化、法治化风险处置机制，遵循风险处置成本最小化原则 。我国存款保险制度明确不能定位于单纯的“付款箱”，可运用监测预警、早期纠正等手段参与风险防范、化解、处置全过程 。
我国采取风险最小化型存款保险制度，存款保险基金管理机构除执行赔付任务外，还可对投保银行采取早期纠正措施和风险处置措施 。2016年风险差别费率开始实施，通过风险定价约束金融机构行为，抑制道德风险 。
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