Windows Server 2003 R2是微软公司于2005年发布的服务器操作系统，基于Windows Server 2003 Service Pack 1开发，其后续版本为Windows Server 2008 。
该版本在Windows Server 2003基础上增强管理功能，支持标准版、企业版、Datacenter版及其x64版本 。系统新增分支办事处服务器管理模块，通过分布式文件系统（DFS）实现文件复制，采用远程差异压缩算法（RDC）降低网络传输需求 。存储管理引入文件服务器资源管理器（FSRM）、SAN存储管理器及Common Log File System（CLFS）日志系统 。身份管理新增Active Directory Federation Services（ADFS），支持跨安全边界的Web单一签入 。
系统集成UNIX身份管理组件，支持NFS文件共享及特殊UNIX设备访问，同时引入动态授权许可机制扩展服务器使用价值。安装需两张光盘，包含Windows Server 2003 SP1基础系统与R2组件 ，支持从Windows 2000 Server等旧系统升级。硬件管理采用基于WS-Management的WinRM协议远程监控服务器，虚拟化支持单台物理服务器运行4个虚拟实例 。
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