日本国驻上海总领事馆（Consulate General of Japan in Shanghai）是日本在上海市设立的外交机构，位于长宁区万山路8号，现任总领事为赤松秀一，领区涵盖上海、江苏、浙江、安徽、江西四省一市 。该馆于1975年9月2日正式设立，系亚洲国家中最早在沪设立领事机构的代表 。
1974年8月中日启动设领协商，1975年8月15日双方通过互换外交照会达成互设总领事馆协议，中方同意日本在上海设领，日方则批准中国在大阪设领。建馆初期领区仅限于上海市，1985年5月起逐步扩展至现辖区域，馆址自设立起沿用至今 。
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